ジャンヌピンク・桃咲晶、ジャンヌブルー・青姫涼、ジャンヌイエロー・黄乃蘭は、麗装戦隊ジャンヌ3として、人間を滅亡させようとする魔物たちの組織ダークスと戦い続けて来た。しかし惑星直列によって地球が闇に覆われ、ジャンヌ3のパワーの源であるアースジュエルが力を失い、三人は完全に変身できなくなってしまう。そこを敵幹部アヌビスに襲われた晶は囚われの身となり壮絶な拷問にかけられる。涼と蘭が助けに来て晶は死の寸前に救出されるが、アヌビスを倒す代償に蘭が命を失ってしまう。二人になってしまったジャンヌ3に、ダークスの総裁ハーデスは牙をむき襲いかかる。晶と涼をたっぷりと苦しめて殺すために、ハーデスは二人の記憶をさぐり、晶の最愛の人間であった蘭を魔物グリフォンとして、涼の最愛の人間であり、ダークスとの戦いの中で命を失っていた弟の達也を魔物ガルーダとして生き返らせ二人に襲いかからせる。最初は偽物と思っていた晶と涼だが会話の中から蘭と達也が本物であることを確信し、本気で戦えなくなる。しかし、死の世界へ最愛の人間である晶と涼を連れて行こうとする蘭と達也は、容赦なく晶と涼を痛めつけて弱らせていく。絶体絶命の危機に追い込まれた二人の女戦士に死の時が近づいてくる。